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Modelo Conceptual
Descripción
Modelo D5.3 - Espectroscopia Metabólica
El modelo conceptual busca comprender los mecanismos que dan origen a un comportamiento, y describirlos de la forma más simple posible. Para eso, el comportamiento se segmenta en temas (grupos): cada uno identifica los objetos o variables que participan —tanto en su funcionamiento normal como en sus posibles anomalías o desviaciones— y describe, mediante verbos, la forma en que esos objetos interactúan entre sí. El resultado es lo que llamamos una red semántica: la estructura con la que representamos y comunicamos el modelo conceptual, antes de introducir ecuación alguna.
ID:2179
Estructura de los Grupos
Descripción
El primer paso consiste en analizar la descripción general del modelo e identificar los distintos aspectos que intervienen en el fenómeno y que deben ser representados. Cada uno de estos aspectos se organiza como un grupo, entendido como una unidad conceptual coherente que describe una parte específica del funcionamiento del modelo.
Cada grupo reúne los objetos o conceptos relevantes para ese aspecto y las relaciones o verbos que describen cómo interactúan, se modifican o dependen unos de otros. De esta manera, cada grupo constituye una parte de la red semántica del modelo, mientras que el conjunto de los grupos permite representar de forma estructurada su funcionamiento global.
La división en grupos facilita además separar mecanismos, condiciones, procesos y resultados que cumplen funciones diferentes dentro del modelo, manteniendo al mismo tiempo las relaciones que existen entre ellos. Los grupos no son, por tanto, componentes aislados: pueden compartir conceptos y establecer relaciones entre sí, formando conjuntamente una única representación semántica del fenómeno.
La imagen anterior ofrece una visión general de los distintos aspectos en que se ha estructurado el modelo. A continuación se presentan los grupos identificados, indicando para cada uno su título y una breve descripción del aspecto del modelo que representa.
Grupo 1: Grupo 1: Composición metabólica
Define el extracto químico interno y las familias de analitos: metabolitos energéticos, carbohidratos, lípidos, intermediarios del ciclo de Krebs y productos de estrés. La composición y concentración de cada metabolito son los observables centrales que las técnicas posteriores estiman.
Grupo 2: Grupo 2: Espectrofotometría UV-visible
Cuantifica metabolitos coloreados o absorbentes mediante Beer-Lambert. La absorbancia aumenta con la concentración para una longitud de paso y absortividad dadas. La relación sirve como rama cuantitativa óptica del perfil metabólico.
Grupo 3: Grupo 3: Resonancia magnética nuclear
Identifica metabolitos por desplazamiento químico característico y cuantifica mediante la integral del pico. El storyboard establece una relación proporcional entre integral y concentración. Esta rama aporta simultáneamente identidad estructural y abundancia.
Grupo 4: Grupo 4: Marcaje isotópico y flujos
Introduce glucosa marcada en posiciones específicas y rastrea la redistribución del carbono marcado entre metabolitos. La evolución del enriquecimiento isotópico informa flujos netos y de intercambio en reacciones enzimáticas. La forma cinética exacta no está especificada y debe calibrarse con series temporales.
Grupo 5: Grupo 5: Separación cromatográfica
HPLC o cromatografía de gases separan metabolitos individuales del extracto antes de cuantificarlos. Cada pico cromatográfico representa una especie separada bajo un método concreto. La respuesta del detector se convierte en cantidad mediante calibración.
Grupo 6: Grupo 6: Espectrometría de masas acoplada
La cromatografía aporta separación y la espectrometría de masas añade identificación por masa molecular. La combinación permite identificar simultáneamente un gran número de metabolitos. El número de metabolitos identificados controla la cobertura del perfil metabolómico.
Grupo 7: Grupo 7: Perfil metabolómico integrado
Integra identidades y concentraciones provenientes de UV-visible, RMN y cromatografía-espectrometría de masas, junto con la información de flujo isotópico. El resultado es un perfil metabolómico del insecto cuya completitud aumenta con la cantidad de metabolitos identificados simultáneamente. Las discrepancias entre técnicas quedan como diagnóstico de consistencia, no se fuerzan a cero.
ID:1230
Grupo 1: Grupo 1: Composición metabólica
Descripción
Define el extracto químico interno y las familias de analitos: metabolitos energéticos, carbohidratos, lípidos, intermediarios del ciclo de Krebs y productos de estrés. La composición y concentración de cada metabolito son los observables centrales que las técnicas posteriores estiman.
Pregunta clave: ¿Cómo opera composición metabólica?
Define el extracto químico interno y las familias de analitos: metabolitos energéticos, carbohidratos, lípidos, intermediarios del ciclo de Krebs y productos de estrés. La composición y concentración de cada metabolito son los observables centrales que las técnicas posteriores estiman. Por eso este modelo, con esta composición química interna de un insecto y estos mismos metabolitos energéticos con los que se abrió, hace que esta misma espectrometría de masas acoplada a esta misma cromatografía combine, en consecuencia, tanto a esta separación cromatográfica final con la que ya se abrió este párrafo como a una propia identificación final por masa molecular de cada metabolito, permitiendo en consecuencia obtener a un propio perfil metabolómico final completo, con una cantidad enorme de estos mismos metabolitos energéticos e intermediarios del ciclo de Krebs con los que se abrió este modelo, todos ellos identificados de manera simultánea dentro de ese mismo insecto. Esta misma espectroscopia metabólica analiza, en general, a la propia composición química interna final de un insecto, exactamente este mismo insecto que ya establece otro modelo de este conjunto, precisamente para cuantificar en consecuencia tanto a cada metabolito energético de ese insecto, como a este mismo carbohidrato y a este mismo lípido que ya establece otro modelo distinto de este conjunto sobre una oxidación biológica, como también a cada intermediario final de su propio ciclo de Krebs y a cada producto final de un estrés particular de ese mismo insecto. La resonancia magnética nuclear constituye, en cambio, al propio método más informativo estructuralmente de toda esta misma espectroscopia metabólica: cada metabolito de este insecto posee, en consecuencia, a un propio desplazamiento químico único final que identifica a ese mismo metabolito, y la propia integral final de ese mismo pico resulta, en consecuencia, proporcional a su propia concentración particular dentro de ese insecto.
ID:5807
Grupo 2: Grupo 2: Espectrofotometría UV-visible
Descripción
Cuantifica metabolitos coloreados o absorbentes mediante Beer-Lambert. La absorbancia aumenta con la concentración para una longitud de paso y absortividad dadas. La relación sirve como rama cuantitativa óptica del perfil metabólico.
Pregunta clave: ¿Cómo opera espectrofotometría uv-visible?
Cuantifica metabolitos coloreados o absorbentes mediante Beer-Lambert. La absorbancia aumenta con la concentración para una longitud de paso y absortividad dadas. La relación sirve como rama cuantitativa óptica del perfil metabólico. Esta misma espectrofotometría ultravioleta-visible cuantifica, en cambio, a cada metabolito coloreado o a cada metabolito que absorbe luz de ese insecto, según la misma ley de Beer-Lambert que ya establece otro modelo de este conjunto sobre esta misma absorción de una radiación electromagnética, exactamente esta misma ley que ya reutiliza además ese otro modelo distinto de este conjunto sobre este mismo dióxido de carbono.
ID:5808
Grupo 3: Grupo 3: Resonancia magnética nuclear
Descripción
Identifica metabolitos por desplazamiento químico característico y cuantifica mediante la integral del pico. El storyboard establece una relación proporcional entre integral y concentración. Esta rama aporta simultáneamente identidad estructural y abundancia.
Pregunta clave: ¿Cómo opera resonancia magnética nuclear?
Identifica metabolitos por desplazamiento químico característico y cuantifica mediante la integral del pico. El storyboard establece una relación proporcional entre integral y concentración. Esta rama aporta simultáneamente identidad estructural y abundancia. La resonancia magnética nuclear constituye, en cambio, al propio método más informativo estructuralmente de toda esta misma espectroscopia metabólica: cada metabolito de este insecto posee, en consecuencia, a un propio desplazamiento químico único final que identifica a ese mismo metabolito, y la propia integral final de ese mismo pico resulta, en consecuencia, proporcional a su propia concentración particular dentro de ese insecto. Que esta concentración de este metabolito particular dentro de ese insecto sea mayor hace que, en consecuencia, esta misma integral final de ese pico de resonancia magnética nuclear, en consecuencia, resulte también todavía mayor. Esta misma espectrofotometría ultravioleta-visible cuantifica, en cambio, a cada metabolito coloreado o a cada metabolito que absorbe luz de ese insecto, según la misma ley de Beer-Lambert que ya establece otro modelo de este conjunto sobre esta misma absorción de una radiación electromagnética, exactamente esta misma ley que ya reutiliza además ese otro modelo distinto de este conjunto sobre este mismo dióxido de carbono.
ID:5809
Grupo 4: Grupo 4: Marcaje isotópico y flujos
Descripción
Introduce glucosa marcada en posiciones específicas y rastrea la redistribución del carbono marcado entre metabolitos. La evolución del enriquecimiento isotópico informa flujos netos y de intercambio en reacciones enzimáticas. La forma cinética exacta no está especificada y debe calibrarse con series temporales.
Pregunta clave: ¿Cómo opera marcaje isotópico y flujos?
Introduce glucosa marcada en posiciones específicas y rastrea la redistribución del carbono marcado entre metabolitos. La evolución del enriquecimiento isotópico informa flujos netos y de intercambio en reacciones enzimáticas. La forma cinética exacta no está especificada y debe calibrarse con series temporales. Este mismo análisis de flujos metabólicos, mediante un propio marcaje isotópico de este mismo carbono que ya establece este documento, constituye, en cambio, a la propia técnica más avanzada final de toda esta misma espectroscopia metabólica: se alimenta, en consecuencia, a este insecto con esta misma glucosa que ya establece otro modelo de este conjunto, marcada isotópicamente en unas posiciones específicas particulares, y se rastrea, en consecuencia, cómo se distribuye ese mismo marcaje entre cada metabolito de ese insecto, revelando en consecuencia tanto al propio flujo neto final como al propio flujo de intercambio final de cada enzima particular de ese mismo insecto. Que este marcaje isotópico de esta glucosa alimentada a ese insecto se distribuya todavía con mayor rapidez entre estos mismos metabolitos hace que, en consecuencia, este mismo flujo neto final de esa enzima particular, en consecuencia, resulte revelado con mayor precisión.
ID:5810
Grupo 5: Grupo 5: Separación cromatográfica
Descripción
HPLC o cromatografía de gases separan metabolitos individuales del extracto antes de cuantificarlos. Cada pico cromatográfico representa una especie separada bajo un método concreto. La respuesta del detector se convierte en cantidad mediante calibración.
Pregunta clave: ¿Cómo opera separación cromatográfica?
HPLC o cromatografía de gases separan metabolitos individuales del extracto antes de cuantificarlos. Cada pico cromatográfico representa una especie separada bajo un método concreto. La respuesta del detector se convierte en cantidad mediante calibración. Por eso este modelo, con esta composición química interna de un insecto y estos mismos metabolitos energéticos con los que se abrió, hace que esta misma espectrometría de masas acoplada a esta misma cromatografía combine, en consecuencia, tanto a esta separación cromatográfica final con la que ya se abrió este párrafo como a una propia identificación final por masa molecular de cada metabolito, permitiendo en consecuencia obtener a un propio perfil metabolómico final completo, con una cantidad enorme de estos mismos metabolitos energéticos e intermediarios del ciclo de Krebs con los que se abrió este modelo, todos ellos identificados de manera simultánea dentro de ese mismo insecto. Esta misma cromatografía, ya sea esta misma cromatografía líquida de alta resolución o esta misma cromatografía de gases, separa, en cambio, y cuantifica, en consecuencia, a cada metabolito individual dentro de un extracto de tejido particular de este mismo insecto.
ID:5811
Grupo 6: Grupo 6: Espectrometría de masas acoplada
Descripción
La cromatografía aporta separación y la espectrometría de masas añade identificación por masa molecular. La combinación permite identificar simultáneamente un gran número de metabolitos. El número de metabolitos identificados controla la cobertura del perfil metabolómico.
Pregunta clave: ¿Cómo opera espectrometría de masas acoplada?
La cromatografía aporta separación y la espectrometría de masas añade identificación por masa molecular. La combinación permite identificar simultáneamente un gran número de metabolitos. El número de metabolitos identificados controla la cobertura del perfil metabolómico. Por eso este modelo, con esta composición química interna de un insecto y estos mismos metabolitos energéticos con los que se abrió, hace que esta misma espectrometría de masas acoplada a esta misma cromatografía combine, en consecuencia, tanto a esta separación cromatográfica final con la que ya se abrió este párrafo como a una propia identificación final por masa molecular de cada metabolito, permitiendo en consecuencia obtener a un propio perfil metabolómico final completo, con una cantidad enorme de estos mismos metabolitos energéticos e intermediarios del ciclo de Krebs con los que se abrió este modelo, todos ellos identificados de manera simultánea dentro de ese mismo insecto. Que esta espectrometría de masas acoplada a esa cromatografía identifique todavía una cantidad mayor de estos metabolitos de manera simultánea hace que, en consecuencia, este mismo perfil metabolómico final de ese insecto, en consecuencia, resulte todavía más completo.
ID:5812
Grupo 7: Grupo 7: Perfil metabolómico integrado
Descripción
Integra identidades y concentraciones provenientes de UV-visible, RMN y cromatografía-espectrometría de masas, junto con la información de flujo isotópico. El resultado es un perfil metabolómico del insecto cuya completitud aumenta con la cantidad de metabolitos identificados simultáneamente. Las discrepancias entre técnicas quedan como diagnóstico de consistencia, no se fuerzan a cero.
Pregunta clave: ¿Cómo opera perfil metabolómico integrado?
Integra identidades y concentraciones provenientes de UV-visible, RMN y cromatografía-espectrometría de masas, junto con la información de flujo isotópico. El resultado es un perfil metabolómico del insecto cuya completitud aumenta con la cantidad de metabolitos identificados simultáneamente. Las discrepancias entre técnicas quedan como diagnóstico de consistencia, no se fuerzan a cero. Por eso este modelo, con esta composición química interna de un insecto y estos mismos metabolitos energéticos con los que se abrió, hace que esta misma espectrometría de masas acoplada a esta misma cromatografía combine, en consecuencia, tanto a esta separación cromatográfica final con la que ya se abrió este párrafo como a una propia identificación final por masa molecular de cada metabolito, permitiendo en consecuencia obtener a un propio perfil metabolómico final completo, con una cantidad enorme de estos mismos metabolitos energéticos e intermediarios del ciclo de Krebs con los que se abrió este modelo, todos ellos identificados de manera simultánea dentro de ese mismo insecto. Que esta espectrometría de masas acoplada a esa cromatografía identifique todavía una cantidad mayor de estos metabolitos de manera simultánea hace que, en consecuencia, este mismo perfil metabolómico final de ese insecto, en consecuencia, resulte todavía más completo. Este mismo análisis de flujos metabólicos, mediante un propio marcaje isotópico de este mismo carbono que ya establece este documento, constituye, en cambio, a la propia técnica más avanzada final de toda esta misma espectroscopia metabólica: se alimenta, en consecuencia, a este insecto con esta misma glucosa que ya establece otro modelo de este conjunto, marcada isotópicamente en unas posiciones específicas particulares, y se rastrea, en consecuencia, cómo se distribuye ese mismo marcaje entre cada metabolito de ese insecto, revelando en consecuencia tanto al propio flujo neto final como al propio flujo de intercambio final de cada enzima particular de ese mismo insecto.
ID:5813