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Modelo Matemático
Descripción
Modelo E10 - Cinética receptor-ligando
Una vez estructurada la red semántica, se busca asociar cada objeto a una variable que permita su formulación matemática. Las relaciones entre variables —expresadas en la red semántica como vectores y asociaciones entre objetos— se traducen en ecuaciones que describen el comportamiento. Estas ecuaciones se buscan, en la mayor medida posible, basadas en primeros principios, y no en algoritmos ajustados numéricamente solo para reproducir comportamientos medidos. El resultado es la red lógica del modelo: el conjunto de variables, con sus unidades y rangos, y las ecuaciones que las relacionan.
ID:3980
Estructura de los Grupos
Descripción
El primer paso consiste en analizar la descripción general del modelo e identificar los distintos aspectos que intervienen en el fenómeno y que deben ser representados. Cada uno de estos aspectos se organiza como un grupo, entendido como una unidad conceptual coherente que describe una parte específica del funcionamiento del modelo.
Cada grupo reúne los objetos o conceptos relevantes para ese aspecto y las relaciones o verbos que describen cómo interactúan, se modifican o dependen unos de otros. De esta manera, cada grupo constituye una parte de la red semántica del modelo, mientras que el conjunto de los grupos permite representar de forma estructurada su funcionamiento global.
La división en grupos facilita además separar mecanismos, condiciones, procesos y resultados que cumplen funciones diferentes dentro del modelo, manteniendo al mismo tiempo las relaciones que existen entre ellos. Los grupos no son, por tanto, componentes aislados: pueden compartir conceptos y establecer relaciones entre sí, formando conjuntamente una única representación semántica del fenómeno.
La imagen anterior ofrece una visión general de los distintos aspectos en que se ha estructurado el modelo. A continuación se presentan los grupos identificados, indicando para cada uno su título y una breve descripción del aspecto del modelo que representa.
Grupo 1: Grupo 1: Unión reversible receptor-ligando
¿Cómo se forma y se deshace reversiblemente el complejo receptor-ligando?
Grupo 2: Grupo 2: Afinidad receptor-ligando
¿Cómo resumen las constantes de asociación y disociación la afinidad del receptor por el ligando?
Grupo 3: Grupo 3: Ocupación de receptores en equilibrio
¿Cómo cambia la fracción de receptores ocupados con la concentración de ligando libre en equilibrio?
Grupo 4: Grupo 4: Cooperatividad y relación de Hill
¿Cómo cambia la ocupación cuando múltiples sitios del receptor presentan unión cooperativa?
Grupo 5: Grupo 5: Conservación del receptor total
¿Cómo se vinculan las formas libre y unida del receptor por conservación del receptor total?
Grupo 6: Grupo 6: Desensibilización del receptor
¿Cómo reduce una exposición prolongada al ligando la respuesta funcional pese a una ocupación sostenida?
Grupo 7: Grupo 7: Competencia entre ligandos
¿Cómo se acoplan dos ligandos que compiten por el mismo sitio de unión mediante el receptor libre compartido?
Grupo 8: Grupo 8: Respuesta funcional dosis-respuesta
¿Cómo se transforma la ocupación y el estado del receptor en una respuesta funcional saturable?
ID:1332