D5 Diagnostic moléculaire et génomique

Topique

Le diagnostic moléculaire du cancer repose sur l'analyse directe des paramètres génomiques décrivant l'évolution clonale d'une tumeur. Il identifie les mutations motrices qui stimulent la prolifération tumorale, telles que les mutations du gène codant pour le récepteur du facteur de croissance épidermique (EGFR) ou d'autres gènes moteurs connus.

Outre ces mutations motrices, le diagnostic moléculaire du cancer analyse également d'autres paramètres de cette même évolution clonale : les biomarqueurs prédictifs de la réponse à l'immunothérapie, comme le nombre total de mutations accumulées par la tumeur, la présence d'une instabilité génétique (instabilité microsatellitaire) ou le niveau d'expression de la molécule inhibitrice des lymphocytes T ; les déficits des mécanismes de réparation du matériel génétique tumoral ; et les mutations de résistance apparaissant au cours du traitement.

Toutes ces informations recueillies par le diagnostic moléculaire du cancer transforment un diagnostic générique comme « cancer du poumon » en un diagnostic beaucoup plus précis et exploitable : par exemple, « adénocarcinome pulmonaire présentant une mutation spécifique du gène du récepteur du facteur de croissance épidermique, traitable en première ligne par osimertinib » – une précision diagnostique qui n’existait tout simplement pas avant le diagnostic moléculaire du cancer.

L’application systématique de ce diagnostic moléculaire du cancer a été rendue possible par le séquençage de nouvelle génération, qui a considérablement réduit le coût et le temps d’analyse du génome entier d’une tumeur : ce qui prenait des semaines ne prend plus que quelques jours, et le temps nécessaire à l’analyse d’un seul gène permet désormais d’analyser simultanément des panels complets de milliers de gènes.

Grâce à cette réduction du temps et des coûts, le séquençage de nouvelle génération est devenu le traitement de référence pour le cancer du poumon non à petites cellules, le mélanome, le cancer colorectal, le cancer de l’ovaire et de nombreuses autres tumeurs. Le profil moléculaire qu'il produit n'est plus un test supplémentaire demandé après avoir décidé du traitement : il constitue la base même sur laquelle se fonde la décision concernant le traitement anticancéreux à prescrire.

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